Prof. Antoine-Emmanuel Saliba
Über
Antoine-Emmanuel Saliba studierte Bioverfahrenstechnik am Institut National des Sciences Appliqués (INSA) in Toulouse (Frankreich) und promovierte in der Forschungsgruppe von Jean-Louis Viovy am Institut Curie in Paris. Er setzte mikrofluidbasierte Systeme zur Sortierung und Analyse seltener Subpopulationen von Krebszellen ein. Anschließend arbeitete er als Stipendiat der interdisziplinären Postdoc Initiative (EIPOD) des Europäischen Laboratoriums für Molekularbiologie (EMBL) in Heidelberg. Dort war er an der Entwicklung innovativer systembiologischer Ansätze zur Analyse von Protein-Lipid-Wechselwirkungen beteiligt. Als Postdoc kam er anschließend ans Labor von Jörg Vogel in Würzburg und etablierte dort die Technologie der Einzelzell-RNA-Sequenzierung. Mit deren Hilfe verfolgte er beispielsweise das Schicksal einzelner Zellen während einer Infektion mit Salmonella enterica. Seit 2017 leitet er die Gruppe Einzelzellanalyse am HIRI. Er ist seit 2023 außerdem Professor (W2) an der Medizinischen Fakultät der Universität Würzburg.
2025
Resolving spatiotemporal dynamics in bacterial multicellular populations: approaches and challenges
Espinoza Miranda SS, Abbaszade G, Hess WR, Drescher K, Saliba AE, Zaburdaev V, Chai L, Dreisewerd K, Grünberger A, Westendorf C, Müller S, Mascher T (2025)
Microbiology and Molecular Biology Reviews (Online ahead of print): e0013824DOI: 10.1128/mmbr.00138-24
2024
Alternating high-fat diet enhances atherosclerosis by neutrophil reprogramming
Lavillegrand JR, Al-Rifai R, Thietart S, Guyon T, Vandestienne M, Cohen R, Duval V, Zhong X, Yen D, Ozturk M, …, Riksen NP, Ait-Oufella H (2024)
Nature 634 (8033): 447-456DOI: 10.1038/s41586-024-07693-6
A novel in vitro tubular model to recapitulate features of distal airways: The bronchioid
Maurat E, Raasch K, Leipold AM, Henrot P, Zysman M, Prevel R, Trian T, Krammer T, Bergeron V, Thumerel M, …, Recher G, Dupin I (2024)
The European Respiratory journal 64 (4)DOI: 10.1183/13993003.00562-2024
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
Friedrich VD, Pennitz P, Wyler E, Adler JM, Postmus D, Müller K, Teixeira Alves LG, Prigann J, Pott F, Vladimirova D, …, Kirsten H, Nouailles G (2024)
EBioMedicine 108: 105312DOI: 10.1016/j.ebiom.2024.105312
Characterization and implementation of the MarathonRT template-switching reaction to expand the capabilities of RNA-Seq
Guo LT, Grinko A, Olson S, Leipold A, Graveley B, Saliba AE, Pyle AM (2024)
RNA 30 (11): 1495–1512DOI: 10.1261/rna.080032.124
The life-saving benefit of dexamethasone in severe COVID-19 is linked to a reversal of monocyte dysregulation
Knoll R, Helbig ET, Dahm K, Bolaji O, Hamm F, Dietrich O, van Uelft M, Müller S, Bonaguro L, Schulte-Schrepping J, …, Aschenbrenner AC, Kurth F (2024)
Cell 187 (16): 4318-4335.e20DOI: 10.1016/j.cell.2024.06.014
L-Wnk1 Deletion in Smooth Muscle Cells Causes Aortitis and Inflammatory Shift
Quelquejay H, Al-Rifai R, Silvestro M, Vandestienne M, Ferreira I, Mirault T, Henrion D, Zhong X, Santos-Zas I, Goudot G, …, Jeunemaitre X, Ait-Oufella H (2024)
Circulation Research 135 (4): 488-502DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.124.324366
CD8+ T Cells Drive Plaque Smooth Muscle Cell Dedifferentiation in Experimental Atherosclerosis
Schäfer S, Gogiraju R, Rösch M, Kerstan Y, Beck L, Garbisch J, Saliba AE, Gisterå A, Hermanns HM, Boon L, …, Cochain C, Zernecke A (2024)
Arteriosclerosis Thrombosis, and Vascular biology 44 (8): 1852-1872DOI: 10.1161/ATVBAHA.123.320084
Characterization of a Human Respiratory Mucosa Model to Study Odorant Metabolism
Mérignac-Lacombe J, Kornbausch N, Sivarajan R, Boichot V, Berg K, Oberwinkler H, Saliba AE, Loos HM, Ehret Kasemo T, Scherzad A, …, Heydel JM, Steinke M (2024)
Journal of Agricultural and Food Chemistry 72 (22): 12696-12706DOI: 10.1021/acs.jafc.4c00752
TREM2 protects from atherosclerosis by limiting necrotic core formation
Piollet M, Porsch F, Rizzo G, Kapser F, Schulz DJ, Kiss MG, Schlepckow K, Morenas-Rodriguez E, Sen MO, Gropper J, …, Binder CJ, Cochain C (2024)
Nature Cardiovascular Research 3 (3): 269-282DOI: 10.1038/s44161-024-00429-9
Decoding spatiotemporal transcriptional dynamics and epithelial fibroblast crosstalk during gastroesophageal junction development through single cell analysis
Kumar N, Prakash PG, Wentland C, Kurian SM, Jethva G, Brinkmann V, Mollenkopf HJ, Krammer T, Toussaint C, Saliba AE, …, Gurumurthy RK, Chumduri C (2024)
Nature Communications 15 (1): 3064DOI: 10.1038/s41467-024-47173-z
Human cytomegalovirus exploits STING signaling and counteracts IFN/ISG induction to facilitate infection of dendritic cells
Costa B, Becker J, Krammer T, Mulenge F, Durán V, Pavlou A, Gern OL, Chu X, Li Y, Cicin-Šain L, …, Erhard F, Kalinke U (2024)
Nature Communications 15 (1): 1745DOI: 10.1038/s41467-024-45614-3
Sequential Antigen-loss and Branching Evolution in Lymphoma after CD19- and CD20-Targeted T-cell Redirecting Therapy
Duell J, Leipold AM, Appenzeller S, Fuhr V, Rauert-Wunderlich H, Da Vià MC, Dietrich O, Toussaint C, Imdahl F, Eisele F, …, Saliba AE, Rasche L (2024)
Blood 143 (8): 685-696DOI: 10.1182/blood.2023021672