Technologietransfer

Bakteriophagen – Viren, die Bakterien befallen – weisen eine enorme genetische sowie phänotypische Vielfalt auf und bergen ein großes Potenzial für biotechnologische und medizinische Anwendungen. Um dieses Potenzial auszuschöpfen, müssen jedoch essentielle Gene funktionell charakterisiert werden. Die hier vorgestellte Technologie bietet eine Methode zum Abschalten von Boten-RNA (mRNA, von engl. messenger RNA) in Phagen durch den Einsatz von Antisense-Oligomeren (ASOs), die die Kartierung von Genen sowohl in DNA- als auch in RNA-Phagen ermöglicht. Der nicht-gentechnische Ansatz könnte für industrielle Anwendungen nützlich sein, bei denen Fermentationsprozesse vor einer Kontamination durch Phagen geschützt werden müssen, oder für die Optimierung der Phagentherapie.

CRISPR-Interferenz (CRISPRi), die auf ein katalytisch inaktives Cas-Protein abzielt, um die Transkription zu blockieren, ist die führende Technik zum Ausschalten von Genen in Bakterien. Allerdings sind die Designregeln für CRISPRi noch nicht ausreichend definiert, was die Entwicklung wirksamer Werkzeuge erschwert. Diese Technologie bietet einen Vorhersagealgorithmus für das Design von Leit-RNA, wodurch die Effizienz von Gen-Silencing verbessert und gleichzeitig die Kosten für das experimentelle Screening reduziert werden.